隨著新三板緊鑼密鼓地推進，各地政府和高科技園區為鼓勵企業，普遍對首批掛牌的企業給予了額度不等的補貼，個別園區的補貼額超過200萬，甚至達到300萬之多。

投融資咨詢機構前瞻投顧表示，目前企業到新三板市場掛牌的中介費用，包括券商、會計師事務所和律師事務所在內的收費總計120-150萬元左右。但很多園區的補助額度都超過了這一數字，基本意味著企業實現掛牌“零成本”。

有媒體記者粗略統計，全國20余個高新區推出的新三板掛牌優惠政策，包括財政補貼、返稅等優惠辦法。其中財政補貼少則40萬元，最高突破300萬元。

目前來看，補貼額度較高的為大連和東莞。大連高新區企業補貼金額為290萬元，其中大連市政府補貼140萬元，高新園區資助150萬元。而東莞松山湖高新區掛牌后備名單的企業，可獲得資助總額達200萬元；對于前10名掛牌的企業，資助金額最高達300萬元。

至于新晉納入新三板試點園區的上海、武漢、天津三地高新園區，也先后提高了補貼金額：

上海張江高科技園區：最高補貼金額提高至160萬元，成功改制最高獲得補貼金額60萬元，掛牌成功則可以獲得100萬元，張江高科技園區曾多次調高補貼金額，前一次補貼金額為80萬元，最早的補貼金額為30萬元。

武漢東湖開發區：對掛牌新三板的獎勵政策從120萬提高至175萬元，首批掛牌成功的企業額外補貼50萬元。

天津濱海高新區：給予100萬元獎勵，有重大貢獻的掛牌企業最高給予320萬元獎勵。此外，掛牌融資2000萬元以上的企業，新增部分稅收連續3年給予80%獎勵。目前，該園區在4個試點中補貼力度最大。

除了補貼之外，地方政府還企圖打通區域股權交易中心和新三板之間的通道。8月5日，廣州市政府常務會議審議并通過了相關方案，近10家在廣州股權交易中心掛牌培育的企業擬首批轉板到“新三板”。

不過，前瞻投顧認為，高額補貼只是一個推動導向，在新三板還沒有被市場完全接納的情況下，高新區通過補貼推動企業掛牌上市，但最終吸引企業掛牌的因素，不是高額補貼，而是新三板本身。因此，從這個角度來看，補貼最終會退出，甚至在新三板交易制度改革之后，即使沒有補貼企業也會愿意參與新三板交易。此外，一旦新三板大幅度擴容，掛牌稀缺性會大幅下降，政府補貼也會隨之減少。當然，對于致力于借助資本市場做大做強的高新企業來說，趁著現在補貼力度大，盡早掛牌新三板，也是一個發展的有效路徑。

全國各大高新區對于新三板掛牌企業的補貼優惠政策（統計：金證券）